根據(jù)國家有關(guān)規(guī)定和營業(yè)稅收入的特點，其審計的主要內(nèi)容包括以下幾個方面：
　　(1)審查執(zhí)行國家營業(yè)稅征收管理制度的情況，是否堅持依法征稅，是否存在承包征收國營企業(yè)營業(yè)稅、對納稅人取得的加價收入，和各種名目的價外補貼收入不照章征收營業(yè)稅的情況；對國家決定恢復征收營業(yè)稅的項目如商業(yè)批發(fā)環(huán)節(jié)營業(yè)稅、國營建筑安裝企業(yè)營業(yè)稅等，是否按規(guī)定執(zhí)行，有無拖延不征的情況，是否嚴格按國家規(guī)定的納稅環(huán)節(jié)和稅率征稅，有無將應征零售環(huán)節(jié)營稅的項目，擅自改為按批發(fā)營業(yè)稅征收的情況。
　　(2)審查執(zhí)行國家減稅；免稅政策的情況。國家對營業(yè)稅的減稅免稅控制相當嚴格，除稅法列舉的免稅項目外，個別稅目、稅率的調(diào)整，某類項目經(jīng)營收入的減稅免稅，必須經(jīng)中央財政批準。省、自治區(qū)、直轄市的減免權(quán)限只限于：當納稅人因意外事故和水災、火災等人力不可抗拒事件導致納稅有困難的，有權(quán)批準在一年內(nèi)減稅免稅；對鄉(xiāng)鎮(zhèn)企業(yè)、農(nóng)民個人和個體手工藝匠取得稅法所列舉的經(jīng)營收入項目以及災區(qū)從事自救性生產(chǎn)經(jīng)營取得收入，有權(quán)批準定期減征、免征營業(yè)稅的照頃。地(市)以下政府和稅務機關(guān)基本沒有減免權(quán)限。另外，國家嚴禁用減免營業(yè)稅的辦法“以稅還貸”，解決企業(yè)固定資產(chǎn)投資缺口。應審查地方政府和財稅部門有關(guān)的文件政策規(guī)定和減免稅批準文件，有無超越權(quán)限，違反國家規(guī)定減免稅收的情況，特別是有無劃整為零，搞。以業(yè)養(yǎng)業(yè)。行業(yè)性減免的情況。
　　(3)審查稅款的入庫和劃分、報解情況，檢查稅收收入會計報表、統(tǒng)計報表和有關(guān)的稅收帳簿、憑證記錄等，對已征收的營業(yè)稅收入是否按國家預算科目、預算級次的規(guī)定及時、足額地繳入各級金庫，有無混淆企業(yè)隸屬關(guān)系或按企業(yè)投資來源比例劃分報解其營業(yè)稅收入的情況。
　　(4)審查稅款退庫情況，檢查工商稅收收入會計報表和各項稅收提退表及有關(guān)稅收會計帳簿、憑證記錄，審核征收數(shù)、入庫數(shù)、提退數(shù)的相應關(guān)系是否正確，退庫內(nèi)容是否符合國家規(guī)定，有無違反上下級財政收入入庫科目、級次和比例的規(guī)定，多沖退上級財政收入的情況；有無自空退庫項目的情況，并查明原因。
　　(5)審查代征代扣手續(xù)費的提取、支付情況。國家規(guī)定，城鄉(xiāng)個體商販和部分集體商業(yè)企業(yè)向批發(fā)部門進貨時，由批發(fā)部門代扣代繳零售環(huán)節(jié)營業(yè)稅，稅務部門可從代扣代繳的稅款中，按1%-5%的比例退庫提取手續(xù)費，支付給代扣代繳的單位或個人。應審查有無提高比例提取手續(xù)費的情況；有無將非代征代扣營業(yè)稅也納入提取范圍，提退手續(xù)費的情況。
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