為加強對稅務機關和稅務人員行使稅收執(zhí)法權的監(jiān)督制約，國家稅務總局制定了《稅收違法案件一案雙查辦法》，規(guī)定各級稅務機關在查處納稅人、扣繳義務人稅收違法案件中，發(fā)現(xiàn)有關稅務機關或稅務人員違紀違法線索的，必須依紀依法調(diào)查處置，嚴肅追究問責懲處。2013年，對“8.27”騙取出口退稅和“4.08”虛開增值稅專用發(fā)票等重大涉稅案件開展“一案雙查”，從嚴查處稅收案件背后的腐敗問題，提醒談話12人，誡勉談話11人，行政處分31人，移送司法機關立案查處4人。
　　《辦法》規(guī)定，公民舉報納稅人稅收違法行為，同時舉報稅務機關或稅務人員違紀違法并且問題嚴重，線索具體的;稅務稽查部門在實施案件檢查中發(fā)現(xiàn)稅務機關或稅務人員失職瀆職、濫用職權、貪污受賄或者利用職權侵犯公民權利，涉嫌違紀違法的;重大稅收違法案件，稅務機關認為需要實行一案雙查的，均應按照規(guī)定開展“一案雙查”。
　　《辦法》規(guī)定，稽查部門發(fā)現(xiàn)稅務機關或稅務人員涉嫌與不法分子相勾結，虛開、買賣發(fā)票，騙取國家稅款;為涉案納稅人通風報信、作偽證、說情、影響案件查處;索取、收受賄賂，利用職務之便為自己或者他人謀取利益;經(jīng)商辦企業(yè)或在企業(yè)入股分紅;不履行或者不認真履行職責造成稅款損失等違紀違法行為的事實或線索，應制作《稅務機關(人員)違法違紀線索轉交單》，將有關證據(jù)和材料轉交有管轄權的監(jiān)察部門。監(jiān)察部門負責調(diào)查稅務機關和稅務人員違紀違法問題。
　　《辦法》還明確了問題線索處置的權限、程序和流程。對稽查部門發(fā)現(xiàn)問題或事實隱瞞不報，監(jiān)察部門無正當理由有案不查的，嚴肅追究有關人員的責任。