電子匯兌往來的核算使用的會計科目有：電子匯兌往來、電子匯兌匯差、存放電子匯兌匯差款項、電子匯兌匯差款項存放。
其中：電子匯兌往來和電子匯兌匯差屬于資產(chǎn)負(fù)債共同類科目；存放電子匯兌匯差款項目屬于資產(chǎn)類科目，下級行對上級行清算匯差時使用；電子匯兌匯差款項存放屬于負(fù)債類科目，上級行對下級行清算匯差時使用。發(fā)生電子匯兌業(yè)務(wù)，發(fā)報行按規(guī)定時間將電子匯兌往賬信息上傳支中心，并作賬務(wù)處理。發(fā)出貸報業(yè)務(wù)的會計分錄為(借報業(yè)務(wù)反向處理)：
借：xx 存款 xx 戶
貸：電子匯兌往來 往賬戶
支中心收到所轄經(jīng)辦行傳來的往賬信息經(jīng)匯總后，在規(guī)定的時間內(nèi)上傳給分中心；分中心收到所轄支中心傳來的往賬信息，在規(guī)定的時間內(nèi)上傳給總中心?？傊行母鶕?jù)電子匯兌往賬信息，按收報行自動做成電子匯兌來賬信息并傳輸給各收報分中心。分中心將來賬信息傳輸給各支中心，并向總中心發(fā)出反饋信息。支中心收到分中心傳來的電子匯兌來賬信息，應(yīng)當(dāng)傳輸給所轄收報行。 收報行收到電子匯兌來賬信息，及時打印電子匯兌來賬憑證并處理賬務(wù)。收到貸報業(yè)務(wù)的會計分錄為(收到借報業(yè)務(wù)反向處理)：
借：電子匯兌往來 來賬戶
貸： xx 存款 xx 戶 　　　　 　　
電子匯兌往來形成的資金存欠，采取逐級清算匯差的辦法進(jìn)行清償。這要求各級行逐級在上級行開立匯差清算存款戶并存入資金。 各經(jīng)辦行于每日營業(yè)終了根據(jù)當(dāng)天發(fā)生的電子匯兌往、來賬的借、貸方發(fā)生額軋算差額并編制匯差記賬憑證處理賬務(wù)。當(dāng)日電子匯兌往來借方發(fā)生額大于貸方發(fā)生額為應(yīng)收匯差，反之為應(yīng)付匯差。應(yīng)收匯差的會計分錄為(應(yīng)付匯差反向處理)： 借：存放電子匯兌匯差款項 貸：電子匯兌匯差
地市行根據(jù)自身及全轄發(fā)生的電子匯兌往、來業(yè)務(wù)，計算電子匯兌匯差。如果全轄軋算為應(yīng)收匯差，會計分錄為：
借：存放電子匯兌匯差款項
借：電子匯兌匯差款項存放 XX 行戶
貸：電子匯兌匯差款項存放 XX 行戶
如為應(yīng)付匯差會計分錄為：
借：電子匯兌匯差款項存放 XX 行戶
貸：電子匯兌匯差款項存放 XX 行戶
貸：存放電子匯兌 　　
　　 　
匯差款項分行的處理與地市行相同?？傂懈鶕?jù)各省分行電子匯兌匯差進(jìn)行清算。省分行為應(yīng)收匯差，總行處理的會計分錄為(應(yīng)付匯差反向處理)：
借：電子匯兌匯差 XX 分行戶
貸：電子匯兌匯差款項存放 XX 分行戶
各級行在上級行開立的匯差清算賬戶資金不足支付，應(yīng)通過人民銀行向該賬戶調(diào)入資金；匯差清算賬戶資金充足，通過人民銀行調(diào)出資金。
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