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一、案件素材
某建筑工程公司于2002 年 6月開業(yè)，注冊資本4250萬元，主營業(yè)務(wù)為承攬建筑裝飾工程。該公司是一家較為大型的企業(yè)，業(yè)務(wù)廣泛，每年均有數(shù)億工程款收入,企業(yè)所得稅由國家稅務(wù)局負(fù)責(zé)征收。2011年3月，某市地稅稽查局對該建筑工程公司2008年1月至2009年12月的納稅情況進(jìn)行了日常檢查。檢查發(fā)現(xiàn)，該公司存在少繳營業(yè)稅、少繳城市維護(hù)建設(shè)稅及少代扣代繳個人所得稅的行為。某市地稅局稽查局依法對該公司作出查補營業(yè)稅454023.33元、城市維護(hù)建設(shè)稅31781.63元、教育費附加13620.70元及補扣補繳個人所得稅68632.00元，同時加收滯納金110760.53元，并對該公司沒有按規(guī)定繳納稅款的行為處以少繳稅款0.5倍的罰款，罰款金額277218.48元。
二、檢查發(fā)現(xiàn)的問題及評析
?。ㄒ唬┤〉玫缆饭こ淌杖?，少繳營業(yè)稅及附加
該案中，檢查人員對該公司2009年的“待攤費用”、“開發(fā)成本”科目及該公司提供的工程建設(shè)概算審核情況報告進(jìn)行審查，發(fā)現(xiàn)該公司2010年承建的某項道路項目的工程價款，是由政府采取“以地?fù)Q路”的方式與該公司結(jié)算，即由該公司自帶資金包干完成道路工程的建設(shè)，政府則以道路兩旁的土地為代價，無償劃撥土地補償該公司承建道路的工程價款。調(diào)查人員發(fā)現(xiàn)該公司在“待攤費用”，“開發(fā)成本”等科目反映拆遷及市政建設(shè)工程成本支出總額19,281,727.84元，只按6,888,932.62元申報繳納營業(yè)稅及附加，未按規(guī)定足額申報繳納相關(guān)稅費。
評析：根據(jù)《中華人民共和國營業(yè)稅暫行條例》第七條規(guī)定，納稅人提供應(yīng)稅勞務(wù)、轉(zhuǎn)讓無形資產(chǎn)或銷售不動產(chǎn)的價格明顯偏低并無正當(dāng)理由的，由主管稅務(wù)機關(guān)核定其營業(yè)額?！吨腥A人民共和國營業(yè)稅暫行條例實施細(xì)則》第二十條、《關(guān)于確定我省營業(yè)稅核定計稅價格公式中成本利潤問題的通知》（粵地稅發(fā)[1996]021號）中規(guī)定，計稅價格明顯偏低無正當(dāng)理由的應(yīng)按下列公式核定營業(yè)額：營業(yè)成本或工程成本×（1+成本利潤率）÷（1-營業(yè)稅稅率），廣東省確定成本利潤率為10%，核定營業(yè)額：營業(yè)成本或工程成本×（1+成本利潤率）÷（1-營業(yè)稅稅率）=21,865,876.93元。案中該公司只按6,888,932.62元申報繳納營業(yè)稅及附加，應(yīng)補：營業(yè)稅（21,865,876.93-6,888,932.62）×3%=449308.33元、城建稅31451.58元、教育費附加13479.25元。
?。ǘ┺D(zhuǎn)讓上市公司股票收入，少繳營業(yè)稅及附加
在審查該公司“短期投資”明細(xì)賬時，發(fā)現(xiàn)該公司2009年2月以410000元從證券市場購入某股票，并于同年的10月將該股票出售取得收入504300元，取得價差收入94300元，當(dāng)年度未按規(guī)定申報繳納營業(yè)稅。
評析：根據(jù)《中華人民共和國營業(yè)稅暫行條例實施細(xì)則》第十八條的規(guī)定，外匯、有價證券、期貨等金融商品買賣業(yè)務(wù)，是指納稅人從事的外匯、有價證券、非貨物期貨和其他金融商品買賣業(yè)務(wù)?！吨腥A人民共和國營業(yè)稅暫行條例》第五條的規(guī)定，外匯、有價證券、期貨等金融商品買賣業(yè)務(wù)，以賣出價減去買入價后的余額為營業(yè)額。因此，該公司從事股票買賣業(yè)務(wù)取得的價差收入應(yīng)按上述規(guī)定繳納營業(yè)稅。應(yīng)補：營業(yè)稅（504300-410000）×5%=4715元、城建稅330.05元、教育費附加141.45元。
?。ㄈ┢髽I(yè)為員工繳納年金,少扣繳個人所得稅
該公司從2008年1月份開始建立企業(yè)年金基金，企業(yè)和個人均按上年度職工工資總額的一定比例繳納年金。該企業(yè)在2008年和2009年共為員工繳納年金443622元，未按規(guī)定代扣代繳個人所得稅。同時該公司在扣繳個人所得稅時未將員工個人繳費部分合并計入工資薪金計算個人所得稅。以上二項合計少扣繳個人所得稅68632.00元。
評析：根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)年金個人所得稅征收管理有關(guān)問題的通知》（國稅函[2009]694號）的規(guī)定，企業(yè)年金的個人繳納部分，不得在個人當(dāng)月工資、薪金計算個人所得稅時扣除。案中該公司未將個人繳納的年金合并計入工資薪金收入代扣代繳個人所得稅?！秶叶悇?wù)總局關(guān)于企業(yè)年金個人所得稅有關(guān)問題補充規(guī)定的公告》（國家稅務(wù)總局公告2011年第9號）規(guī)定，在計算企業(yè)支付的年金應(yīng)補扣補繳稅款時，以每年度未扣繳企業(yè)繳費部分為應(yīng)納稅所得額，以當(dāng)年每個職工月平均工資額的適用稅率為所屬期企業(yè)繳費的適用稅率，匯總計算各年度應(yīng)扣繳稅款。該公司在2008年、2009年為員工繳納的企業(yè)年金均沒有代扣代繳個人所得稅。
以該公司其中一名員工黃某2008年的年金繳納為例：
1、2008年6月該公司為員工黃某發(fā)放工資3400元（已扣社保和規(guī)定的公積金、不含已繳個人年金），個人繳年金500元，但該部分無合并計入工資薪金中代扣代繳個人所得稅。應(yīng)補繳的個人所得稅計算如下：
應(yīng)納稅所得額：（3400+500）-2000=1900元
工資薪金應(yīng)納個人所得稅：1900×10%－25＝165元
應(yīng)補繳個人所得稅：165-115=50元
2、該公司2008年6月為員工黃某繳納一次性年金6000元，但2008年度未按規(guī)定代扣代繳個人所得稅。已知2008年員工黃某月平均工資額為4000元，則該公司為員工黃某支付的年金應(yīng)扣繳個人所得稅計算方法如下：
員工黃某當(dāng)年月平均工資額為4000元，減除法定費用扣除額2000元后，根據(jù)國家稅務(wù)總局公告2011年第9號規(guī)定和上述情況，可以確定企業(yè)為員工黃某繳納年金個人所得稅稅率為10%，速算扣除數(shù)為25。
2008年6月企業(yè)為員工黃某支付年金應(yīng)補扣補繳個人所得稅：6000×10%-25=575元。
兩項合計黃某應(yīng)補個人所得稅：（50+575）=625元。
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