增值稅專用發(fā)票是由國(guó)家稅務(wù)總局監(jiān)制設(shè)計(jì)印制的，只限于增值稅一般納稅人領(lǐng)購(gòu)使用的，既作為納稅人反映經(jīng)濟(jì)活動(dòng)中的重要會(huì)計(jì)憑證又是兼記銷貨方納稅義務(wù)和購(gòu)貨方進(jìn)項(xiàng)稅額的合法證明;是增值稅計(jì)算和管理中重要的決定性的合法的專用發(fā)票。
 
　　1、利用防偽稅控認(rèn)證子系統(tǒng)對(duì)企業(yè)提供的抵扣聯(lián)進(jìn)行防偽認(rèn)證(對(duì)計(jì)算機(jī)不能識(shí)別但票面清晰的專用發(fā)票，按票面信息進(jìn)行人工校正)，根據(jù)認(rèn)證結(jié)果的不同，分以下情況進(jìn)行處理：
　　(1)認(rèn)證相符的專用發(fā)票(包括人工校正認(rèn)證相符)認(rèn)證完畢后，當(dāng)場(chǎng)向企業(yè)下達(dá)《認(rèn)證結(jié)果通知書》和認(rèn)證清單，要求企業(yè)當(dāng)場(chǎng)核對(duì)發(fā)票份數(shù)，并返還企業(yè)認(rèn)證相符的增值稅專用發(fā)票;
　　(2)無法認(rèn)證、納稅人識(shí)別號(hào)認(rèn)證不符和發(fā)票代碼號(hào)碼認(rèn)證不符(指密文和明文相比較，發(fā)票代碼或號(hào)碼不符)的發(fā)票，將發(fā)票原件退還納稅人;
　　(3)密文有誤、認(rèn)證不符(不包括納稅人識(shí)別號(hào)認(rèn)證不符和發(fā)票代碼號(hào)碼認(rèn)證不符)和抵扣聯(lián)重號(hào)的專用發(fā)票必須當(dāng)即扣留;對(duì)遠(yuǎn)程認(rèn)證結(jié)果為“認(rèn)證未通過”的專用發(fā)票抵扣聯(lián)，應(yīng)在發(fā)現(xiàn)的當(dāng)日通知納稅人于2日內(nèi)持專用發(fā)票抵扣聯(lián)原件到稅務(wù)機(jī)關(guān)再次認(rèn)證，對(duì)仍認(rèn)證不符的或密文有誤的發(fā)票，必須當(dāng)即扣留;
　　(4)對(duì)于扣留的專用發(fā)票(包括運(yùn)輸發(fā)票)，認(rèn)證人員應(yīng)填寫《增值稅專用發(fā)票抵扣聯(lián)扣留通知書》，隨同《認(rèn)證結(jié)果通知書》和《專用發(fā)票認(rèn)證結(jié)果清單》交納稅人作為扣留憑證，同時(shí)填寫《認(rèn)證不符或密文有誤專用發(fā)票轉(zhuǎn)辦單》，與扣留的專用發(fā)票抵扣聯(lián)原件及電子數(shù)據(jù)，于發(fā)現(xiàn)的當(dāng)日移送稽查部門;專用發(fā)票注明金額在十萬元以上的，則須立即將專用發(fā)票原件和電子數(shù)據(jù)移送稽查局查處，同時(shí)將此情況立即向主管領(lǐng)導(dǎo)報(bào)告，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)要立即將此情況以電話直接通知總局，并最遲于次日將專用發(fā)票復(fù)印件、《防偽稅控認(rèn)證不符和密文有誤增值稅專用發(fā)票情況表》直接傳至總局，同時(shí)逐級(jí)抄報(bào)省局。
 
　　2、如果企業(yè)報(bào)送稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)證的發(fā)票抵扣聯(lián)已污損、褶皺、揉搓，無法運(yùn)用認(rèn)證子系統(tǒng)進(jìn)行認(rèn)證的，可允許納稅人用相應(yīng)的其他聯(lián)次進(jìn)行認(rèn)證(采集)，處理方式同上。

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