對于股權(quán)激勵的會計處理問題，財政部在2006年頒布的《企業(yè)會計準(zhǔn)則第11號—股份支付》已經(jīng)進行了規(guī)范。實施股權(quán)激勵的上市公司在2006年后都按照11號準(zhǔn)則進行了會計處理。但是，對于股權(quán)激勵的企業(yè)所得稅處理問題，國家稅務(wù)總局一直沒有明確的規(guī)定。實際上，缺少對股權(quán)激勵企業(yè)所得稅處理的明確規(guī)定，上市公司對于股權(quán)激勵的會計處理也是不完整的。會計和稅法上對于股權(quán)激勵的處理差異，會導(dǎo)致所得稅會計的處理問題。
　　由于稅收政策上對于股權(quán)激勵的處理規(guī)定一直不明確，上市公司無法對于股權(quán)激勵無法按照《企業(yè)會計準(zhǔn)則第18號—所得稅》規(guī)定的原則進行所得稅會計處理，從而導(dǎo)致披露的報表并不準(zhǔn)確。
　　2012年5月23日，國家稅務(wù)總局發(fā)布了《國家稅務(wù)總局關(guān)于我國居民企業(yè)實行股權(quán)激勵計劃有關(guān)企業(yè)所得稅處理問題的公告》 國家稅務(wù)總局公告2012年第18號），明確了我國對于股權(quán)激勵企業(yè)所得稅的處理原則。該公告規(guī)定：上市公司依照《管理辦法》要求建立職工股權(quán)激勵計劃，并按我國企業(yè)會計準(zhǔn)則的有關(guān)規(guī)定，在股權(quán)激勵計劃授予激勵對象時，按照該股票的公允價格及數(shù)量，計算確定作為上市公司相關(guān)年度的成本或費用，作為換取激勵對象提供服務(wù)的對價。
 
　　上述企業(yè)建立的職工股權(quán)激勵計劃，其企業(yè)所得稅的處理，按以下規(guī)定執(zhí)行：
　?。ㄒ唬蓹?quán)激勵計劃實行后立即可以行權(quán)的，上市公司可以根據(jù)實際行權(quán)時該股票的公允價格與激勵對象實際行權(quán)支付價格的差額和數(shù)量，計算確定作為當(dāng)年上市公司工資薪金支出，依照稅法規(guī)定進行稅前扣除。
 
　　（二）對股權(quán)激勵計劃實行后，需待一定服務(wù)年限或者達(dá)到規(guī)定業(yè)績條件（以下簡稱等待期）方可行權(quán)的。上市公司等待期內(nèi)會計上計算確認(rèn)的相關(guān)成本費用，不得在對應(yīng)年度計算繳納企業(yè)所得稅時扣除。在股權(quán)激勵計劃可行權(quán)后，上市公司方可根據(jù)該股票實際行權(quán)時的公允價格與當(dāng)年激勵對象實際行權(quán)支付價格的差額及數(shù)量，計算確定作為當(dāng)年上市公司工資薪金支出，依照稅法規(guī)定進行稅前扣除。
 
　?。ㄈ┍緱l所指股票實際行權(quán)時的公允價格，以實際行權(quán)日該股票的收盤價格確定。
　　對照國家稅務(wù)總局18號公告和《企業(yè)會計準(zhǔn)則第11號—股份支付》，我們可以看出，稅法和會計對于股權(quán)激勵的處理存在著明顯的差異：
　　根據(jù)《企業(yè)會計準(zhǔn)則第11號—股份支付》的規(guī)定：除了立即可行權(quán)的股份支付外，無論權(quán)益結(jié)算的股份支付還是現(xiàn)金結(jié)算的股份支付，企業(yè)在授予日均不做會計處理。企業(yè)應(yīng)當(dāng)在等待期內(nèi)的每個資產(chǎn)負(fù)債表日，將取得職工或其他方提供的服務(wù)計入成本費用，同時確認(rèn)所有者權(quán)益或負(fù)債。對于附有市場條件的股份支付，只要職工滿足了其他所有非市場條件，企業(yè)就應(yīng)當(dāng)確認(rèn)已經(jīng)取得的服務(wù)。
　　根據(jù)國家稅務(wù)總局18號公告的規(guī)定，對于股權(quán)激勵，在稅收處理上，上市公司等待期內(nèi)會計上計算確認(rèn)的相關(guān)成本費用，在當(dāng)期不能在計算企業(yè)所得稅應(yīng)納稅所得額是進行扣除。實施股權(quán)激勵的企業(yè)，只有在股權(quán)激勵計劃可行權(quán)后，按照該股票實際行權(quán)時的公允價格（一般是實際行權(quán)日該股票收盤價）與當(dāng)年激勵對象實際行權(quán)支付價格的差額及數(shù)量，計算確定作為當(dāng)年上市公司工資薪金支出，依照稅法規(guī)定進行稅前扣除。
　　無論是在股權(quán)激勵成本費用金額的確認(rèn)上還是在扣除時點的確定上，會計和稅法都存在明顯的差異。由此，導(dǎo)致了企業(yè)需要根據(jù)《企業(yè)會計準(zhǔn)則第18號—所得稅》規(guī)定的原則進行所得稅會計處理。
　　對于股權(quán)激勵的所得稅會計處理問題，財政部在《企業(yè)會計準(zhǔn)則講解（2010）》中說的比較簡略。對于“與股份支付相關(guān)的當(dāng)期及遞延所得稅”的問題，該書規(guī)定：“與股份支付相關(guān)的支出在按照會計準(zhǔn)則規(guī)定確認(rèn)為成本時，其相關(guān)的所得稅影響應(yīng)區(qū)別于稅法的規(guī)定進行處理。
　　如果稅法規(guī)定與股份支付相關(guān)的支出不允許稅前扣除，則不形成暫時性差異；如果稅法規(guī)定與股份支付相關(guān)的支出允許稅前扣除，在按照會計準(zhǔn)則規(guī)定確認(rèn)成本費用的期間，企業(yè)應(yīng)當(dāng)根據(jù)會計期末取得的信息估計可稅前扣除的金額計算確定其計稅基礎(chǔ)及由此產(chǎn)生的暫時性差異，符合確認(rèn)條件的情況下應(yīng)當(dāng)確認(rèn)相關(guān)的遞延所得稅。其中預(yù)計未來期間可稅前扣除的金額超過按照會計準(zhǔn)則規(guī)定確認(rèn)的與股份支付相關(guān)的成本費用，超過部分的所得稅影響應(yīng)直接計入所有者權(quán)益。“
　　《企業(yè)會計準(zhǔn)則講解（2010）》在總局18號公告之前出版，當(dāng)時對于股權(quán)激勵的企業(yè)所得稅處理還不明確。目前，根據(jù)總局18號公告的規(guī)定，稅法上允許額企業(yè)扣除與股份支付相關(guān)的成本費用。因此，在所得稅會計上，企業(yè)應(yīng)按規(guī)定進行遞延所得稅的處理。但是，《企業(yè)會計準(zhǔn)則講解（2010）》規(guī)定比較原則，其中企業(yè)如何根據(jù)會計期末取得的信息估計可稅前扣除的金額計算確定其計稅基礎(chǔ)及由此產(chǎn)生的暫時性差異是整個問題的核心。
　　期權(quán)的價值=時間價值（time value）+內(nèi)在價值（intrinsic value）
　　企業(yè)根據(jù)《企業(yè)會計準(zhǔn)則第11號—股份支付》規(guī)定，在等待期內(nèi)每個資產(chǎn)負(fù)債表日確認(rèn)為成本費用的金額是根據(jù)期權(quán)的價值來計算的（對于權(quán)益結(jié)算的股份支付，是根據(jù)授予日權(quán)益工具的公允價值計算，并不確認(rèn)后續(xù)公允價值的變動。對于現(xiàn)金結(jié)算的股份支付，應(yīng)當(dāng)按照每個資產(chǎn)負(fù)債表日權(quán)益工具的公允價值計量），其中既包括時間價值也包括內(nèi)在價值。
　　而根據(jù)總局18號公告的規(guī)定，最終企業(yè)可以在企業(yè)所得稅前扣除的費用只是該股票實際行權(quán)時的公允價格（一般是實際行權(quán)日該股票收盤價）與當(dāng)年激勵對象實際行權(quán)支付價格的差額，這部分差額實際上是期權(quán)的內(nèi)在價值。因此，企業(yè)所得稅上只允許扣除期權(quán)的內(nèi)在價值，不允許扣除期權(quán)的時間價值。因此，時間價值不形成暫時性差異，不需要進行所得稅會計處理。而內(nèi)在價值的變動則形成暫時性差異，需要我們按照《企業(yè)會計準(zhǔn)則第18號—所得稅》規(guī)定的原則進行所得稅會計處理。