在國(guó)家稅務(wù)總局2013年開(kāi)展的藥品、醫(yī)療器械生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)單位和醫(yī)療機(jī)構(gòu)發(fā)票使用情況的專項(xiàng)整治活動(dòng)中，上海市S區(qū)稅務(wù)局稽查局成功查處一起A醫(yī)療有限公司（以下簡(jiǎn)稱A公司）違規(guī)作廢增值稅普通發(fā)票的案件，涉案金額近400萬(wàn)元。
在核查2010年和2011年H醫(yī)院采購(gòu)信息及銷售方開(kāi)票信息時(shí)，檢查人員發(fā)現(xiàn)，供貨商A公司每個(gè)月開(kāi)給H醫(yī)院的發(fā)票中都有作廢發(fā)票，H醫(yī)院把絕大部分作廢發(fā)票都已列支成本。是巧合，還是有意為之？檢查人員就此展開(kāi)深入檢查。
A公司1995年11月注冊(cè)成立，注冊(cè)資本50萬(wàn)元，注冊(cè)類型為私營(yíng)有限責(zé)任公司，主要經(jīng)營(yíng)醫(yī)療器械產(chǎn)品批發(fā)零售，是增值稅一般納稅人。該公司年銷售收入比較穩(wěn)定，平均年銷售額約200萬(wàn)元，此前未受過(guò)稅務(wù)行政處罰。
檢查人員到A公司，獲得了公司合同、開(kāi)票數(shù)據(jù)及其他相關(guān)資料。初次詢問(wèn)過(guò)程中，A公司法定代表人J某矢口否認(rèn)存在違規(guī)作廢發(fā)票的情況，稱由于醫(yī)院要求貨物和發(fā)票同時(shí)送達(dá)，經(jīng)常會(huì)發(fā)生開(kāi)票金額超過(guò)醫(yī)院部門(mén)當(dāng)月預(yù)算額度的情況，因此被要求退票重開(kāi)。
當(dāng)檢查人員試圖核對(duì)A公司記賬憑證及銀行日記賬時(shí)，J某抗拒地表示，這些資料大都已經(jīng)遺失。于是，檢查人員再次來(lái)到與A公司業(yè)務(wù)往來(lái)最多的H醫(yī)院，開(kāi)展外圍調(diào)查取證工作。檢查人員了解了H醫(yī)院采購(gòu)該公司醫(yī)療器械的業(yè)務(wù)流程和付款情況，采集了H醫(yī)院收受A公司所有發(fā)票信息。經(jīng)查，A公司供貨至醫(yī)院同時(shí)開(kāi)出發(fā)票，醫(yī)院根據(jù)發(fā)票聯(lián)金額支付貨款，退票重開(kāi)的情況雖有發(fā)生，但比例很小。檢查人員將H醫(yī)院受票信息與A公司開(kāi)票信息導(dǎo)入數(shù)據(jù)庫(kù)，運(yùn)用技術(shù)手段分析比對(duì)，整理后的數(shù)據(jù)顯示，H醫(yī)院已入賬列支成本的增值稅普通發(fā)票中，A公司擅自作廢154份，累計(jì)不含稅金額達(dá)255萬(wàn)元。
檢查人員得知A公司還專門(mén)為H醫(yī)院的貨款往來(lái)在S銀行N支行開(kāi)立了一般賬戶，于是按程序申請(qǐng)調(diào)閱A公司在S銀行N支行銀行對(duì)賬單，并與H醫(yī)院采購(gòu)入賬信息比對(duì)，鎖定A公司真實(shí)的銷售金額。同時(shí)，檢查人員調(diào)查詢問(wèn)A公司業(yè)務(wù)員，從票、貨、款三方面取證固定了相關(guān)證據(jù)。J某無(wú)法再自圓其說(shuō)，只得承認(rèn)了違規(guī)作廢發(fā)票的事實(shí)。但J某一再?gòu)?qiáng)調(diào)，H醫(yī)院為其*5的客戶，違規(guī)作廢發(fā)票的情形只存在于對(duì)H醫(yī)院的業(yè)務(wù)往來(lái)中。
事實(shí)真相是否如此？檢查人員整理A公司原始銷售記錄，并對(duì)A公司在S銀行另一支行開(kāi)立的基本賬戶逐筆核對(duì)收入，梳理出全部貨物和發(fā)票的流向，最終發(fā)現(xiàn)，該公司在將醫(yī)療器械銷往其他醫(yī)院和外地客戶過(guò)程中，同樣存在違規(guī)作廢發(fā)票的情況。A公司為避免一次性作廢發(fā)票數(shù)量過(guò)大或銷售額、稅負(fù)率異常波動(dòng)引起稅務(wù)機(jī)關(guān)懷疑，每個(gè)月只作廢幾份發(fā)票，作廢發(fā)票的日期不固定，發(fā)票號(hào)碼也不連號(hào)，但每份發(fā)票的金額均在萬(wàn)元以上。經(jīng)匯總統(tǒng)計(jì)，共計(jì)211份增值稅普通發(fā)票在購(gòu)買(mǎi)方列支成本后被違規(guī)作廢，累計(jì)不含稅金額近400萬(wàn)元。
根據(jù)稅法相關(guān)規(guī)定，稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)A公司追繳稅款及附加稅費(fèi)、加收滯納金、處罰款等共計(jì)約150萬(wàn)元，同時(shí)以涉嫌逃避繳納稅款罪移交司法機(jī)關(guān)作進(jìn)一步處理。