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實行國庫集中支付的事業(yè)單位，財政資金的支付方式包括財政直接支付和財政授權支付。
(一)財政直接支付的程序
事業(yè)單位應于收到財政國庫支付執(zhí)行機構委托銀行轉來的“財政直接支付入賬通知書”時，按入賬通知書中表明的金額確認財政補助收入，同時計入相關支出或增計相關資產。年度終了，事業(yè)單位依據本年度財政直接支付預算指標數(shù)與當年財政直接支付實際數(shù)的差額，確認財政補助收入并增計財政應返還額度;下年度恢復財政直接支付額度后，行政事業(yè)單位在發(fā)生實際支出時，應沖減財政應返還額度的會計處理。
(二)財政授權支付的程序
事業(yè)單位應于實際收到代理銀行蓋章的“授權支付到賬通知書”時，按照通知書標明的數(shù)額確認財政補助收入，并增計零余額賬戶用款額度，支付額度時作沖減零余額賬戶用款額度的會計處理。年度終了，事業(yè)單位依據代理銀行提供的對賬單注銷額度時，增記財政應返還額度，并沖減零余額賬戶用款額度;如果單位本年度財政授權支付預算指標數(shù)大于零余額賬戶用款額度下達數(shù)，根據兩者的差額，確認財政補助收入并增記財政應返還額度，下年初恢復額度或下年度收到財政部門批復的上年未下達零余額賬戶用款額度時，作沖減財政應返還額度的會計處理。
(三)國庫集中支付業(yè)務的賬務處理
事業(yè)單位應當設置“財政補助收入”、“零余額賬戶用款額度”、“財政應返還額度”等科目，核算國庫集中支付業(yè)務。
1.財政直接支付方式
(1)收到“財政直接支付入賬通知書”時
借：事業(yè)支出等
貸：財政補助收入
(2)年度終了，根據本年度財政直接支付預算指標數(shù)與當年財政直接支付實際支出數(shù)的差額
借：財政應返還額度--財政直接支付
貸：財政補助收入
(3)下年度恢復財政直接支付額度后，事業(yè)單位以財政直接支付方式發(fā)生實際支出時
借：事業(yè)支出等
貸：財政應返還額度--財政直接支付
【提示】恢復財政直接支付額度時不做會計處理，發(fā)生實際支出時做會計處理。
2.財政授權支付方式
(1)收到代理銀行蓋章的“授權支付到賬通知書”時
借：零余額賬戶用款額度
貸：財政補助收入
(2)按規(guī)定支用額度時
借：事業(yè)支出等
貸：零余額賬戶用款額度
(3)年度終了，依據代理銀行提供的對賬單為注銷額度的
借：財政應返還額度--財政授權支付
貸：零余額賬戶用款額度
(4)下年初恢復額度時
借：零余額賬戶用款額度
貸：財政應返還額度--財政授權支付
(5)財政授權支付預算指標數(shù)大于零余額賬戶用款額度下達數(shù)
?、倌甓冉K了，根據未下達的用款額度
借：財政應返還額度--財政授權支付
貸：財政補助收入
?、谙履甓仁盏截斦块T批復的上年末未下達零余額賬戶用款額度時
借：零余額賬戶用款額度
貸：財政應返還額度--財政授權支付
