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所得稅政策問題的通知》（財(cái)稅〔2008〕151號(hào)）、《財(cái)政部國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于全國(guó)社會(huì)保障基金有關(guān)企業(yè)所得稅問題的通知》（財(cái)稅〔2008〕136號(hào)）、《財(cái)政部國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于專項(xiàng)用途財(cái)政性資金有關(guān)企業(yè)所得稅處理問題的通知》（財(cái)稅〔2009〕87號(hào)）的下發(fā)，特別是87號(hào)文件使得2008-2010年期間，大量企業(yè)取得的財(cái)政性資金被判定為不征稅收入，其納稅申報(bào)如何處理，一直未被明確，例如：河南省地稅局就規(guī)定，2009年度匯算清繳，事業(yè)單位、社會(huì)團(tuán)體、民辦非企業(yè)單位以外的企業(yè)取得的不征稅收入暫填寫在附表三納稅調(diào)整項(xiàng)目明細(xì)表第19行，并附說明。
通知明確了企業(yè)取得的不征稅收入的填報(bào)方法，即：企業(yè)符合上述文件規(guī)定的不征稅收入，填報(bào)企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表附表三“納稅調(diào)整明細(xì)表”“一、收入類調(diào)整項(xiàng)目”第14行“13、不征稅收入”對(duì)應(yīng)列次。上述不征稅收入用于支出形成的費(fèi)用和資產(chǎn)，不得稅前扣除或折舊、攤銷，作相應(yīng)納稅調(diào)整。其中，用于支出形成的費(fèi)用，填報(bào)該表第38行“不征稅收入用于所支出形成的費(fèi)用；其用于支出形成的資產(chǎn)，填報(bào)該表第41行項(xiàng)目下對(duì)應(yīng)行次。
?。ㄋ模┟舛愂杖氲奶顖?bào)口徑。
《企業(yè)所得稅法》第二十六條規(guī)定了四類免稅收入，一般認(rèn)為在法律未授權(quán)的情況下，無論是國(guó)務(wù)院還是財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局都是無權(quán)再設(shè)定免稅收入的。但是，出于社會(huì)宏觀調(diào)控的特殊目的，財(cái)政部和國(guó)家稅務(wù)總局在未被明確授權(quán)的情況下，出臺(tái)了《財(cái)政部國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于期貨投資者保障基金有關(guān)稅收問題的通知》（財(cái)稅〔2009〕68號(hào)），對(duì)期貨保障基金公司取得的相關(guān)收入也確認(rèn)為免稅收入。
通知規(guī)定，該項(xiàng)免稅收入填報(bào)在企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表附表五“稅收優(yōu)惠明細(xì)表”“一、免稅收入”第5行“4、其他”。
?。ㄎ澹┩顿Y損失扣除填報(bào)口徑。
《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于做好2007年度企業(yè)所得稅匯算清繳工作的補(bǔ)充通知》（國(guó)稅函【2008】264號(hào)）文件第二條第二款規(guī)定：企業(yè)因收回、轉(zhuǎn)讓或清算處置股權(quán)投資而發(fā)生的權(quán)益性投資轉(zhuǎn)讓損失，可以在稅前扣除，但每一納稅年度扣除的股權(quán)投資損失，不得超過當(dāng)年實(shí)現(xiàn)的股權(quán)投資收益和股權(quán)投資轉(zhuǎn)讓所得，超過部分可向以后納稅年度結(jié)轉(zhuǎn)扣除。企業(yè)股權(quán)投資轉(zhuǎn)讓損失連續(xù)向后結(jié)轉(zhuǎn)5年仍不能從股權(quán)投資收益和股權(quán)投資轉(zhuǎn)讓所得中扣除的，準(zhǔn)予在該股權(quán)投資轉(zhuǎn)讓年度后第6年一次性扣除。
企業(yè)所得稅納稅申報(bào)表附表十一“長(zhǎng)期股權(quán)投資所得損失”，據(jù)此設(shè)計(jì)了“投資損失補(bǔ)充資料”。
《企業(yè)所得稅法》實(shí)施后，長(zhǎng)期股權(quán)投資損失是否能在當(dāng)年扣除的政策引起了廣泛爭(zhēng)議。一是，投資損失是否能在當(dāng)年一次性扣除；二是，如果2008年以后產(chǎn)生的投資損失能夠在當(dāng)年一次性扣除，2008年以前的投資損失繼續(xù)遵循國(guó)稅函【2008】264號(hào)文件規(guī)定，還是也可以一次扣除。
《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈企業(yè)資產(chǎn)損失稅前扣除管理辦法〉的通知》（國(guó)稅發(fā)〔2009〕88號(hào)）規(guī)定，企業(yè)發(fā)生的投資（轉(zhuǎn)讓）損失應(yīng)按實(shí)際確認(rèn)或發(fā)生的當(dāng)期扣除。但是，該文件沒有明確以前年度的損失是否可以在2009年度匯算清繳一次性稅前扣除。
通知指出，對(duì)于長(zhǎng)期股權(quán)投資發(fā)生的損失，企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表附表十一“長(zhǎng)期股權(quán)投資所得損失”“投資損失補(bǔ)充資料”的相關(guān)內(nèi)容不再填報(bào)。據(jù)此判斷，既然“投資損失補(bǔ)充資料”不再填報(bào)，也就意味著不但2009年度的股權(quán)投資損失可以一次性扣除，以前年度產(chǎn)生的股權(quán)轉(zhuǎn)讓損失也可以在2009年度一次性扣除。因?yàn)?，如果以前年度產(chǎn)生的損失繼續(xù)遵循國(guó)稅函【2008】264號(hào)文件規(guī)定，納稅申報(bào)表必須要填列到“投資損失補(bǔ)充資料”中。
?。┒愂諆?yōu)惠填報(bào)口徑。
《企業(yè)所得稅法》實(shí)施之前，根據(jù)《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)的免稅所得彌補(bǔ)虧損問題的通知》（國(guó)稅發(fā)【1999】34號(hào)）文件規(guī)定，如果一個(gè)企業(yè)既有應(yīng)稅項(xiàng)目，又有免稅項(xiàng)目，其應(yīng)稅項(xiàng)目發(fā)生虧損時(shí)，按照稅收法規(guī)規(guī)定可以結(jié)轉(zhuǎn)以后年度彌補(bǔ)的虧損，應(yīng)該是沖抵免稅項(xiàng)目所得后的余額。此外，雖然應(yīng)稅項(xiàng)目有所得，但不足彌補(bǔ)當(dāng)年年度虧損的，免稅項(xiàng)目的所得也應(yīng)用于彌補(bǔ)以前年度虧損。
《企業(yè)所得稅法》實(shí)施之后，免稅收入、所得不再需要彌補(bǔ)應(yīng)稅虧損，對(duì)于納稅人來說是利好消息。但是新的問題是，應(yīng)稅所得是否允許彌補(bǔ)免稅的虧損，這一點(diǎn)并未明確，尤其納稅申報(bào)表填報(bào)說明，又沒有規(guī)定免稅所得可以填列負(fù)數(shù)，因此業(yè)界的一些專家認(rèn)為，免稅收入、所得不必彌補(bǔ)應(yīng)稅虧損，但是應(yīng)稅收入、所得可以彌補(bǔ)免稅虧損。
通知明確，對(duì)企業(yè)取得的免稅收入、減計(jì)收入以及減征、免征所得額項(xiàng)目，不得彌補(bǔ)當(dāng)期及以前年度應(yīng)稅項(xiàng)目虧損；當(dāng)期形成虧損的減征、免征所得額項(xiàng)目，也不得用當(dāng)期和以后納稅年度應(yīng)稅項(xiàng)目所得抵補(bǔ)。
值得注意的是，在稅收實(shí)踐中，一些多業(yè)經(jīng)營(yíng)的納稅人，預(yù)計(jì)到本年度免稅項(xiàng)目虧損時(shí)，往往采取不去備案的方式，不享受免稅待遇，從而規(guī)避稅法的規(guī)定。
?。ㄆ撸浹a(bǔ)虧損填報(bào)口徑。
《企業(yè)所得稅法》實(shí)施之前，符合獨(dú)立核算標(biāo)準(zhǔn)的分支機(jī)構(gòu)作為單獨(dú)的納稅人繳納稅款，而《企業(yè)所得稅法》實(shí)施后，法人企業(yè)是獨(dú)立的納稅人。關(guān)于以前年度作為單獨(dú)納稅人，2008年以后不再具有獨(dú)立納稅人資格分支機(jī)構(gòu)以前年度的虧損處理問題，《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法〉的通知》（國(guó)稅發(fā)〔2008〕28號(hào)）規(guī)定，總機(jī)構(gòu)可以全額彌補(bǔ)分支機(jī)構(gòu)2007年及以前年度尚未彌補(bǔ)完的虧損。
由于總機(jī)構(gòu)彌補(bǔ)分支機(jī)構(gòu)以前年度虧損政策，只是暫時(shí)性政策，隨著以前年度虧損期限的到期，該問題將不復(fù)存在，因此附表四“彌補(bǔ)虧損明細(xì)表”并未設(shè)計(jì)專門的欄次。
通知明確，將分支機(jī)構(gòu)以前年度的虧損視同為企業(yè)合并，填入企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表附表四“彌補(bǔ)虧損明細(xì)表”第三列“合并分立企業(yè)轉(zhuǎn)入可彌補(bǔ)虧損額”對(duì)應(yīng)行次。
?。ò耍┢髽I(yè)處置資產(chǎn)確認(rèn)問題。
《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)處置資產(chǎn)所得稅處理問題的通知》（國(guó)稅函〔2008〕828號(hào)）第三條規(guī)定，企業(yè)處置外購(gòu)資產(chǎn)可按購(gòu)入時(shí)的價(jià)格確定銷售收入。關(guān)于這一條規(guī)定，業(yè)界引起了不小的爭(zhēng)議，一部分人認(rèn)為這一條規(guī)定不合理。比如，某企業(yè)購(gòu)入商品房一套，購(gòu)入價(jià)格100萬元，3年后市場(chǎng)公允價(jià)值為300萬元，該企業(yè)將其用于投資，按照本條款規(guī)定視同銷售價(jià)格可以按照購(gòu)入時(shí)的價(jià)格100萬元，而不是300萬元，因此不合理；另外一部分認(rèn)為，文件中的“可”字用的非常精確，是指如果外購(gòu)貨物并未增值，在這種情形下，不能機(jī)械的按照成本利潤(rùn)率計(jì)算視同銷售價(jià)格，而是“可”按照購(gòu)入價(jià)格即可，反之如果購(gòu)進(jìn)貨物德市場(chǎng)公允價(jià)值發(fā)生了重大變化，則不能按照購(gòu)進(jìn)價(jià)格確認(rèn)視同銷售收入。
通知明確，企業(yè)處置外購(gòu)資產(chǎn)按購(gòu)入時(shí)的價(jià)格確定銷售收入，是指企業(yè)處置該項(xiàng)資產(chǎn)不是以銷售為目的，而是具有替代職工福利等費(fèi)用支出性質(zhì)，且購(gòu)買后一般在一個(gè)納稅年度內(nèi)處置。
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