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《增值稅暫行條例》第八條第（四）項規(guī)定，購進或者銷售貨物以及在生產經營過程中支付運輸費用的，按照運輸費用結算單據(jù)上注明的運輸費用金額和7%的扣除率計算的進項稅額。進項稅額計算公式：進項稅額=運輸費用金額×扣除率?！对鲋刀悤盒袟l例實施細則》第十八條規(guī)定，條例第八條第二款第（四）項所稱運輸費用金額，是指運輸費用結算單據(jù)上注明的運輸費用（包括鐵路臨管線及鐵路專線運輸費用）、建設基金，不包括裝卸費、保險費等其他雜費。因此，準予抵扣的進項稅額=（運費+鐵建基金+膠新運費+廣坪運費）×7%。
《國家稅務總局關于鐵路運費進項稅額抵扣有關問題的補充通知》（國稅函［2003］970號）規(guī)定，中國鐵路包裹快運公司(簡稱中鐵快運)為客戶提供運輸勞務，屬于鐵路運輸企業(yè)。因此，對增值稅一般納稅人購進或銷售貨物取得的《中國鐵路小件貨物快運運單》列明的鐵路快運包干費、超重費、到付運費和轉運費，可按7％的扣除率計算抵扣進項稅額。
另外，需要注意的是，根據(jù)《國家稅務總局關于加強貨物運輸業(yè)稅收管理及運輸發(fā)票增值稅抵扣管理的公告》（國稅發(fā)［2003］120號)規(guī)定，納稅人取得的2003年10月31日以后開具的運輸發(fā)票，應當自開票之日起90天內向主管國家稅務局申報抵扣，超過90天的不得予以抵扣?！秶叶悇湛偩株P于調整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關問題的通知》（國稅函［2009］617號）僅對增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、海關進口增值稅專用繳款書、公路內河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票的抵扣期限，由90天調整為180天。因此鐵路運輸發(fā)票抵扣期限仍為90天。
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