首先要區(qū)別補助來源，一般來說一次性傷殘補助金由社保出。一次性工傷醫(yī)療補助金，一次性傷殘就業(yè)補助金由單位出。
員工工傷醫(yī)藥費計入什么科目？
 
根據(jù)需計提人員的工作性質(zhì)和來源作如下分錄：
由社保出
收到時：
借：銀行存款
貸：其他應付款(或應付職工薪酬)
支付時：
借：其他應付款(或應付職工薪酬)
貸：現(xiàn)金(或銀行存款)
由企業(yè)出
計提時：
借：生產(chǎn)成本/銷售費用/管理費用(入職工對應的相關費用)
貸：應付職工薪酬
支付時：
借：應付職工薪酬
貸：銀行存款或現(xiàn)金
應付職工薪酬是企業(yè)根據(jù)有關規(guī)定應付給職工的各種薪酬。
企業(yè)應當通過應付職工薪酬科目，核算應付職工薪酬的提取、結(jié)算、使用等情況。該科目的貸方登記已分配計入有關成本費用項目的職工薪酬的數(shù)額，借方登記實際發(fā)放職工薪酬的數(shù)額，包括扣還的款項等。該科目期末貸方余額，反映企業(yè)應付未付的職工薪酬。
工傷保險賠償打款到單位還要扣稅嗎?
根據(jù)財政部、國家稅務總局《關于工傷職工取得的工傷保險待遇有關個人所得稅政策的通知》財稅【2012】40號
各省、自治區(qū)、直轄市、計劃單列市財政廳(局)、地方稅務局，新疆生產(chǎn)建設兵團財務局：
為貫徹落實《工傷保險條例》(國務院令第586號)，根據(jù)個人所得稅法第四條中經(jīng)國務院財政部門批準免稅的所得的規(guī)定，現(xiàn)就工傷職工取得的工傷保險待遇有關個人所得稅政策通知如下：
1.對工傷職工及其近親屬按照《工傷保險條例》(國務院令第586號)規(guī)定取得的工傷保險待遇，免征個人所得稅。
2.本通知第一條所稱的工傷保險待遇，包括工傷職工按照《工傷保險條例》(國務院令第586號)規(guī)定取得的一次性傷殘補助金、傷殘津貼、一次性工傷醫(yī)療補助金、一次性傷殘就業(yè)補助金、工傷醫(yī)療待遇、住院伙食補助費、外地就醫(yī)交通食宿費用、工傷康復費用、輔助器具費用、生活護理費等，以及職工因工死亡，其近親屬按照《工傷保險條例》(國務院令第586號)規(guī)定取得的喪葬補助金、供養(yǎng)親屬撫恤金和一次性工亡補助金等。
3.本通知自2011年1月1日起執(zhí)行。對2011年1月1日之后已征稅款，由納稅人向主管稅務機關提出申請，主管稅務機關按相關規(guī)定予以退還。
由此可以看出工傷賠償款是不需要扣繳個人所得稅的。
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